B科技 b体育高清3D基因组相互作用图生成—新闻—科学网 来源:B企业 发表时间: 2024-06-16

科技日报北京5月8日电 (记者张佳欣)人类基因组的很年夜一部门是由调控区域构成的,这些区域节制着细胞内哪些基因于给定的时间表达。确定这些调控因子与哪些基因彼此作用,有助在研究职员相识疾病是怎样发生的并找到医治要领。据8日《天然 遗传学》杂志报导,美国麻省理工学院研究职员使用一种新技能,能以高在此前100倍的分辩率绘制这些彼此作用图。

研究职员暗示,使用这类要领,他们天生了有史以来最高分辩率的3D基因组图谱,看到了前所未见的加强子以及启动子之间的年夜量彼此作用。

研究团队起首哄骗了名为Micro-C的较新技能。然而,Micro-C成本昂扬,且仍未到达充足高的分辩率来辨认特定彼此作用的类型。

是以,该团队设计了一种对于基因组彼此作用举行更有针对于性的测序要领,由此一来,可能的基因组位点数目年夜年夜削减,测序成本降至约1000美元。这类名为“区域捕捉微型C(RCMC)”的新要领可以或许以极低的成本天生比其他已经知技能具体100倍的图象。

于测序中,研究职员存眷了5个巨细不等的区域,从数十万到约莫200万个碱基对于。此中包孕一种名为Sox2的特性明确的基因,它于胚胎发育历程中的构造造成中阐扬着要害作用。

于对于方针DNA片断举行测序后,研究职员发明了很多与Sox2彼此作用的加强子,和四周基因以及加强子之间的彼此作用。于其他区域,尤为是那些布满基因以及加强子的区域,一些基因与多达50个其他DNA片断彼此作用,平均每一个彼此作用点与约莫25b����个其他DNA片断彼此作用。

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